Sau năm 1975, huyện Thạch An thuộc tỉnh Cao Lạng, gồm 16 xã: Canh Tân, Danh Sỹ, Đức Long, Đức Thông, Đức Xuân, Kim Đồng, Lê Lai, Lê Lợi, Minh Khai, Quang Trọng, Thái Cường, Thị Ngân, Thượng Pha, Thụy Hùng, Trọng Con, Vân Trình.

Ngày 29 tháng 12 năm 1978, tái lập tỉnh Cao Bằng từ tỉnh Cao Lạng cũ, huyện Thạch An thuộc tỉnh Cao Bằng.

Ngày 11 tháng 8 năm 1999, thành lập thị trấn Đông Khê - thị trấn huyện lị huyện Thạch An - trên cơ sở toàn bộ diện tích và dân số của xã Thượng Pha, 318,32 ha diện tích tự nhiên và 1.112 nhân khẩu của xã Lê Lai.

Ngày 10 tháng 1 năm 2020, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết số 864/NQ-UBTVQH14 về việc sắp xếp các đơn vị hành chính cấp huyện, cấp xã thuộc tỉnh Cao Bằng (nghị quyết có hiệu lực từ ngày 1 tháng 2 năm 2020)[2]. Theo đó:

• Sáp nhập xã Thị Ngân vào xã Vân Trình
• Sáp nhập xã Danh Sỹ vào xã Lê Lợi.

Huyện Thạch An có 1 thị trấn và 13 xã như hiện nay.